Сенсей Ву събира четирима младежи – Кай, Коул, Джей и Зейн, за да ги тренира за нинджи. Те трябва да усвоят силите на елементите и оръжията за спинджицу, за да запазят земята на Нинджаго от злия лорд Гармадон.
След като унищожиха Прокълнатото царство и спасиха Нинджаго, нинджите откриха нова слава. Но те трябва да внимават какво си пожелават, защото ново зло, наречено Надакан Джина, е освободен и е започнал нова епоха на пиратството.
Нинджите трябва да намерят възможно най-много данни за Надакан, преди той да намери Царския кристал, но след като нинджите са обозначени като врагове, нашите герои се оказват преследвани от стария си приятел, Ронин.
Затворени в Криптариум, нинджите намират стар враг. Междувременно Надакан спасява своя закъсал екипаж и придобива нова идея, заедно с нов мистериозен план.
Нинджите пътуват до таен остров, за да получат отрова от Тигровата вдовица, която да използват срещу Надакан. Планът се обърква, когато Надакан и неговите небесни пирати пристигат, за да ги спрат.
Джей трябва да направи каквото е необходимо, за да избяга от злодейските лапи на Надакан, докато останалите нинджи се опитват да оцелеят и да избягат от Острова на тигровата вдовица.
Когато последните двама останали нинджи са защитени на място, което никой не би посмял да погледне, Небесните пирати откриват местонахождението им и нападат.
Спасените нинджи се втурват да спасят Ния, но закъсняват - сватбата с Надакан е завършена. Когато Надакан придобива безкрайни желания, Джей има само едно.
